La Junta General de este Real Academia la componen todos los académicos de número. Constituye el órgano máximo de la Academia y se reúne puntualmente los últimos jueves de cada mes, aunque se celebran muchas juntas extraordinarias en función de las diferentes actividades culturales que lleva a cabo la Academia.
Para su dirección y representación la Junta General designa una Junta de Gobierno constituida por los Académicos de Número que propone la Presidencia. Actualmente, y desde el 21 marzo de 2025, la conforman los siguientes académicos:
Presidenta: Excma. Sra. Dᵃ Rosario Camacho Martínez
Vicepresidente 1º: Ilmo. Sr. D. Ángel Asenjo Díaz
Vicepresidente 2º: Ilmo. Sr. D. Pedro Rodríguez Oliva
Vicepresidente 3º: Ilmo. Don Elías de Mateo Avilés
Secretario: Ilmo. Sr. D. Francisco Ruiz Noguera
Bibliotecario: Ilmo. Sr. D. Marion Reder Gadow
Tesorero: Ilmo. Sr. D. Fernando de la Rosa Ceballo
Director del Anuario: Ilmo. Sr. D. Francisco Javier Boned Purkis
Comisiones Especiales, de desempeño según sus especialidades
Relaciones institucionales: Excmo. Sr. D. José Manuel Cabra de Luna
Archivos: Ilma. Sra. Dª María Pepa Lara.
Imagen corporativa: Ilmo. Sr. D. Sebastián García Garrido.
Comunicación y Publicaciones: Ilmo. Sr. D. José Infante Martos e Ilma. Sra. Dª. Aurora Luque Ortiz.
Patrimonio y Restauración: Ilma. Sra. Dª. María Morente del Monte, Ilmo. Sr. D. Rafael Martín Delgado e Ilma. Sra. Da. Estrella Arcos von Haartman.
