La Junta General de este Real Academia la componen todos los académicos de número. Constituye el órgano máximo de la Academia y se reúne puntualmente los últimos jueves de cada mes, aunque se celebran muchas juntas extraordinarias en función de las diferentes actividades culturales que lleva a cabo la Academia.
Para su dirección y representación la Junta General designa una Junta de Gobierno constituida por los Académicos de Número que propone la Presidencia. Actualmente, y desde febrero de 2020, la conforman los siguientes académicos:
Presidente: Excmo. Sr. D. José Manuel Cabra de Luna
Vicepresidenta 1ª: Ilma. Sra. Dña. Rosario Camacho Martínez
Vicepresidente 2º: Ilmo. Sr. D. Ángel Asenjo Díaz
Vicepresidente 3º: Ilmo. Don Elías de Mateo Avilés
Secretario: Ilmo. Sr. D. José Infante Martos
Bibliotecario: Ilmo. Sr. D. Francisco Ruiz Noguera
Director del Anuario: Ilmo. Sr. D. Francisco Javier Boned Purkis
Tesorero: Ilmo. Sr. D. Fernando de la Rosa Ceballo
Comisiones especiales:
Economía y nueva sede: D. Elías de Mateo Avilés
Imagen Corporativa: D. Sebastián García Garrido
Relaciones Institucionales: D. Pedro Rodríguez Oliva
Discurso de toma de posesión del Presidente de la Academia en 2015